Dobierając średnicę końcówki i moc aparatu należy przede wszystkim ustalić objętość próbki i określić jej podatność na dezintegrację ultradźwiękami. Korzystając z podanych przez producenta zakresów objętości należy wybrać aparat o odpowiedniej mocy, a następnie w ten sam sposób końcówkę o odpowiedniej średnicy.

       Średnica końcówki jest ściśle związana z intensywnością procesu i wielkością obrabianej próbki:

• Końcówki o małych średnicach (np.: mikro-końcówki) emitują energię z wyższą intensywnością, ale w niewielkiej objętości i dlatego powinny być używane jedynie do małych próbek

• Końcówki o dużych średnicach pozwalają na pracą z próbkami o większej objętości, ale intensywność procesu jest mniejsza.

• Do pracy z próbkami „trudnymi” lub o dużej objętości wskazane jest stosowanie końcówek "High Gain" (o większej niż zwykłe intensywności) lub "booster" (podwajających amplitudę).